En visant notamment des économies d'eau et d'énergie, les politiques de développement durable induisent de nouvelles pratiques dont il faut évaluer les risques sanitaires éventuels. De nombreux exemples illustrent les recherches de modalités nouvelles dans un but de développement durable appliqué à l’eau notamment pour mieux gérer la consommation d’eau de la ressource pour la production d’eau du robinet et faire face aux risques de pénurie. Plusieurs travaux d’expertise d’évaluation des risques ont été conduit par l’agence qui incluent : la réutilisation des eaux usées traitées pour l'arrosage ou l'irrigation, l'utilisation de l'eau de mer pour la production d'eau destinée à la consommation humaine, l’installation de turbines hydroélectriques sur des canalisations de production ou de distribution d'eau destinée à la consommation humaine, ou encore utilisation de fluides caloporteurs.


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