Les agents microbiologiques pathogènes pouvant être présents dans l’eau destinée à la consommation humaine (EDCH) sont essentiellement des bactéries, des virus ou des protozoaires, issus pour la plupart d’entre eux des déjections humaines ou animales. Leur présence dans l’eau du robinet est liée à une insuffisance de la protection de la ressource, à un défaut du traitement de l’eau ou à des retours d’eau dans le réseau d’eau potable. Ils peuvent être à l’origine de maladies infectieuses (en France métropolitaine, essentiellement des gastro-entérites aigües) et constituent le principal risque à court terme pour la santé lié à une contamination de l’eau de boisson.
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